Особенности аутофагии в мононуклеарных клетках пациентов с аутоиммунным тиреоидитом

Аутоиммунный тиреоидит (АИТ) – хроническое заболевание щитовидной железы, основную роль в патогенезе которого играют чрезмерно стимулированные CD4⁺Т-лимфоциты, провоцирующие активацию CD8⁺ цитотоксических Т-лимфоцитов, что приводит к Fas-зависимому апоптозу тиреоцитов и снижению гормональной активности щитовидной железы. По данным исследований важным процессом в патогенезе аутоиммунных заболеваний является аутофагия – клеточный процесс, в норме поддерживающий клеточный гомеостаз путем деградации поврежденных белков и органелл в аутолизосомах. Статья посвящена анализу аутофагии и экспрессии ключевых белков – регуляторов аутофагии (Vps34, p62 и LC3) – в мононуклеарах периферической крови пациентов с АИТ. Для оценки развития процесса по изменению количества аутофагосом в клетках использован метод проточной цитофлуориметрии. Уровень экспрессии белков-маркеров определен методом вестерн-блоттинга. Установлено достоверное повышение содержания маркеров аутофагии – Vps34, LC3-II и р62 – в лимфоцитах пациентов с АИТ. Высокий уровень аутофагосомного белка LC3-II коррелирует с высоким уровнем убиквитин-связывающего белка p62, что может свидетельствовать о нарушении терминального этапа аутофагии – слияния аутофагосом и лизосом. При невозможности полноценного протекания всех стадий аутофагии активация данного процесса приводит лишь к чрезмерному накоплению аутофагосом в цитоплазме клеток, что, в свою очередь, способствует активации апоптоза или последующей гибели клетки путем некроза. Таким образом, понимание механизма нарушения аутофагии в лимфоцитах может оказаться перспективным методическим подходом в решении проблемы повреждений, связанных с возникновением и развитием АИТ.

1. Трошина Е.А. Хронический аутоиммунный тиреоидит – «сигнальное заболевание» в составе мультиорганного аутоиммунного синдрома // Проблемы эндокринологии. 2023. Т. 69, № 4. С. 4–10. https://doi.org/10.14341/probl13361.

2. Лукьянчиков В.С. Аутоиммунный тиреоидит. Связь с тиреоидными и неэндокринными метаплазиями // РМЖ. 2013. Т. 21, № 12. С. 657–659.

3. Ragusa F., Fallahi P., Elia G., Gonnella D., Paparo S.R., Giusti C., Churilov L.P., Ferrari S.M., Antonelli A. Hashimotos’ thyroiditis: Epidemiology, pathogenesis, clinic and therapy // Best Pract. Res., Clin. Endocrinol. Metab. 2019. V. 33, No 6. Art. 101367. https://doi.org/10.1016/j.beem.2019.101367.

4. Radetti G. Clinical aspects of Hashimoto’s thyroiditis // G. Szinnai (Ed.) Paediatric Thyroidology. Ser.: Endocrine Development. V. 26. Basel: S. Karger AG, 2014. P. 158–170. https://doi.org/10.1159/000363162.

5. Caturegli P., De Remigis A., Rose N.R. Hashimoto thyroiditis: Clinical and diagnostic criteria // Autoimmun. Rev. 2014. V. 13, Nos 4–5. P. 391–397. https://doi.org/10.1016/j.autrev.2014.01.007.

6. Pyzik A., Grywalska E., Matyjaszek‑Matuszek B., Roliński J. Immune disorders in Hashimoto’s thyroiditis: What do we know so far? // J. Immunol. Res. 2015. V. 2015, No 1. Art. 979167. https://doi.org/10.1155/2015/979167.

7. Salmaso C., Bagnasco M., Pesce G., Montagna P., Brizzolara R., Altrinetti V., Richiusa P., Galluzzo A., Giordano C. Regulation of apoptosis in endocrine autoimmunity: Insights from Hashimoto’s thyroiditis and Graves’ disease // Ann. N. Y. Acad. Sci. 2002. V. 996, No 1. P. 496–501. https://doi.org/10.1111/j.1749-6632.2002.tb04253.x.

8. Vukovic R., Zeljkovic A., Bufan B., Spasojevic‑Kalimanovska V., Milenkovic T., Vekic J. Hashimoto thyroiditis and dyslipidemia in childhood: A review // Front. Endocrinol. 2019. V. 10. Art. 868. https://doi.org/10.3389/fendo.2019.00868.

9. Yang Z., Goronzy J.J., Weyand C.M. Autophagy in autoimmune disease // J. Mol. Med. 2015. V. 93, No 7. P. 707–717. https://doi.org/10.1007/s00109-015-1297-8.

10. Шляпина В.Л., Юртаева С.В., Рубцова М.П., Донцова О.А. На распутье: механизмы апоптоза и аутофагии в жизни и смерти клетки // Acta Nat. 2021. Т. 13, № 2 (49). С. 106–115. https://doi.org/10.32607/actanaturae.11208.

11. Netea‑Maier R.T., Plantinga T.S., van de Veerdonk F.L., Smit J.W., Netea M.G. Modulation of inflammation by autophagy: Consequences for human disease // Autophagy. 2016. V. 12, No 2. P. 245–260. https://doi.org/10.1080/15548627.2015.1071759.

12. Denton D., Kumar S. Autophagy-dependent cell death // Cell Death Differ. 2019. V. 26, No 4. P. 605–616. https://doi.org/10.1038/s41418-018-0252-y.

13. Wu Z.‑Z., Zhang J.‑J., Gao C.‑C., Zhao M., Liu S.‑Y., Gao G.‑M., Zheng Z.‑H. Expression of autophagy related genes mTOR, Becline-1, LC3 and p62 in the peripheral blood mononuclear cells of systemic lupus erythematosus // Am. J. Clin. Exp. Immunol. 2017. V. 6, No 1. P. 1–8.

14. Liang P., Le W. Role of autophagy in the pathogenesis of multiple sclerosis // Neurosci. Bull. 2015. V. 31, No 4. P. 435–444. https://doi.org/10.1007/s12264-015-1545-5.

15. Wua D.J., Adamopoulos I.E. Autophagy and autoimmunity // Clin. Immunol. 2017. V. 176. Р. 55–62. https://doi.org/10.1016/j.clim.2017.01.007.

16. Wang W., Zhang B.‑T., Jiang Q.‑L., Zhao H.‑Q., Xu Q., Zeng Y., Xu J.‑Y., Jiang J. Leptin receptor antagonist attenuates experimental autoimmune thyroiditis in mice by regulating Treg/Th17 cell differentiation // Front. Endocrinol. 2022. V. 13. Art. 1042511. https://doi.org/10.3389/fendo.2022.104251.1.

17. Jia X., Zhai T., Qu C., Ye J., Zhao J., Liu X., Zhang J.‑a., Qian Q. Metformin reverses Hashimoto’s thyroiditis by regulating key immune events // Front. Cell Dev. Biol. 2021. V. 9. Art. 685522. https://doi.org/10.3389/fcell.2021.685522.

18. Recktenwald D., Radbruch A. (Eds.) Cell Separation Methods and Applications. Boca Raton, FL: CRC Press, 1998. 352 p. https://doi.org/10.1201/9781482273649.

19. Kleiveland C.R. Peripheral blood mononuclear cells // Verhoeckx K., Cotter P., LópezExpósito I., Kleiveland C., Lea T., Mackie A., Requena T., Swiatecka D., Wichers H. (Eds.). The Impact of Food Bioactives on Health: In Vitro and Ex Vivo Models. Cham: Springer, 2015. P. 161–167. https://doi.org/10.1007/978-3-319-16104-4_15.

20. Klionsky D.J., Abdalla F.C., Abeliovich H., Abaraham R.T., Acevedo‑Arozena A., Adeli K., Agholme L., Agnello M., Agostinis P., Aguirre‑Ghiso J.A., Ahn H.J., Ait‑Mohamed O., Ait‑Si‑Ali S., Akematsu T., Akira S., Al‑Younes H.M., Al‑Zeer M.A., Albert M.L., Albin R.L., Alegre‑Abarrategui J., Aleo M.F., Alirezaei M., Almasan A., Almonte‑Becerril M., Amano A., Amaravadi R.K., Amarnath S., Amer A.O., Andrieu‑Abadie N., Anantharam V., Ann D.K., Anoopkumar‑Dukie S., Aoki H., Apostolova N., Arancia G., Aris J.P., Asanuma K., Asare N.Y.O., Ashida H., Askanas V., Askew D.S., Auberger P., Baba M., Backues S.K., Baehrecke E.H., Bahr B.A., Bai X.‑Y., Bailly Y., Baiocchi R., Baldini G., Balduini W., Ballabio A., Bamber B.A., Bampton E.T.W, Juhász G., Bartholomew C.R., Bassham D.C., Bast R.C., Batoko H., Bay B.‑H., Beau I., Béchet D.M., Begley T.J., Behl C., Behrends C., Bekri S., Bellaire B., Bendall L.J., Benetti L., Berliocchi L., Bernardi H., Bernassola F., Besteiro S., Bhatia‑Kissova I., Bi X., Biard‑Piechaczyk M., Blum J.S., Boise L.H., Bonaldo P., Boone D.L., Bornhauser B.C., Bortoluci K.R, Bossis I., Bost F., Bourquin J.‑P., Boya P., Boyer‑Guittaut M., Bozhkov P.V., Brady N.R., Brancolini C., Brech A., Brenman J.E., Brennand A., Bresnick E.H., Brest P., Bridges D., Bristol M.L., Brookes P.S, Brown E.J., Brumell J.H., Brunetti‑Pierri N., Brunk U.T., Bulman D.E., Bultman S.J., Bultynck G., Burbulla L.F., Bursch W., Butchar J.P., Buzgariu W., Bydlowski S.P., Cadwell K., Cahová M., Cai D., Cai J., Cai Q., Calabretta B., Calvo‑Garrido J., Camougrand N., Campanella M., Campos‑Salinas J., Candi E., Cao L., Caplan A.B., Carding S.R., Cardoso S.M., Carew J.S., Carlin C.R., Carmignac V., Carneiro L.A.M., Carra S., Caruso R.A., Casari G., Casas C., Castino R., Cebollero E., Cecconi F., Celli J., Chaachouay H., Chae H.‑J., Chai C.‑Y., Chan D.C., Chan E.Y., Chang R.C.‑C., Che C.‑M., Chen C.‑C., Chen G.‑C., Chen G.‑Q., Chen M., Chen Q., Chen S.S.‑L., Chen W., Chen X., Chen X., Chen X., Chen Y.‑G., Chen Y., Chen Y., Chen Y.‑J., Chen Z., Cheng A., Cheng C.H.K., Cheng Y., Cheong H., Cheong J.‑H., Cherry S., Chess‑Williams R., Cheung Z.H., Chevet E., Chiang H.‑L., Chiarelli R., Chiba T., Chin L.‑S., Chiou S.‑H., Chisari F.V., Cho C.H., Cho D.‑H., Choi A.M.K., Choi D., Choi K.S., Choi M.E., Chouaib S., Choubey D., Choubey V., Chu C.T, Chuang T.‑H., Chueh S.‑H., Chun T., Chwae Y.‑J., Chye M.‑L., Ciarcia R., Ciriolo M.R., Clague M.J., Clark R.S.B., Clarke P.G.H., Clarke R., Codogno P., Coller H.A., Colombo M.I., Comincini S., Condello M., Condorelli F., Cookson M.R., Coombs G.H., Coppens I., Corbalan R., Cossart P., Costelli P., Costes S., Coto‑Montes A., Couve E., Coxon F.P., Cregg J.M., Crespo J.L., Cronjé M.J., Cuervo A.M., Cullen J.J., Czaja M.J., D’Amelio M., Darfeuille‑Michaud A., Davids L.M., Davies F.E, De Felici M., de Groot J.F, de Haan C.A.M., De Martino L., De Milito A., De Tata V., Debnath J., Degterev A., Dehay B., Delbridge L.M.D., Demarchi F., Deng Y.Z., Dengjel J., Dent P., Denton D., Deretic V., Desai S.D., Devenish R.J., Di Gioacchino M., Di Paolo G., Di Pietro C., Díaz‑Araya G., Díaz‑Laviada I., Diaz‑Meco M.T., Diaz‑Nido J., Dikic I., Dinesh‑Kumar S.P., Ding W.‑X., Distelhorst C.W., Diwan A., Djavaheri‑Mergny M., Dokudovskaya S., Dong Z., Dorsey F.C., Dosenko V., Dowling J.J., Doxsey S., Dreux M., Drew M.E., Duan Q., Duchosal M.A., Duff K.E., Dugail I., Durbeej M., Duszenko M., Edelstein C.L., Edinger A.L., Egea G., Eichinger L., Eissa N.T., Ekmekcioglu S., El‑Deiry W.S., Elazar Z., Elgendy M., Ellerby L.M., Eng K.E., Engelbrecht A.‑M., Engelender S., Erenpreisa J., Escalante R., Esclatine A., Eskelinen E.‑L., Espert L., Espina V., Fan H., Fan J., Fan Q.‑W., Fan Z., Fang S., Fang Y., Fanto M., Fanzani A., Farkas T., Farre J.‑C., Faure M., Fechheimer M., Feng C.G., Feng J., Feng Q., Feng Y., Fésüs L., Feuer R., Figueiredo‑Pereira M.E., Fimia G.M., Fingar D.C., Finkbeiner S., Finkel T., Finley K.D., Fiorito F., Fisher E.A., Fisher P.B., Flajolet M., Florez‑McClure M.L., Florio S., Fon E.A., Fornai F., Fortunato F., Fotedar R., Fowler D.H., Fox H.S., Franco R., Frankel L.B., Fransen M., Fuentes J.M., Fueyo J., Fujii J., Fujisaki K., Fujita E., Fukuda M., Furukawa R.H., Gaestel M., Gailly P., Gajewska M., Galliot B., Galy V., Ganesh S., Ganetzky B., Ganley I.G., Gao F.‑B., Gao G.F., Gao J., Garcia L., Garcia‑Manero G., Garcia‑Marcos M., Garmyn M., Gartel A.L., Gatti E., Gautel M., Gawriluk T.R., Gegg M.E., Geng J., Germain M., Gestwicki J.E., Gewirtz D.A., Ghavami S., Ghosh P., Giammarioli A.M., Giatromanolaki A.N., Gibson S.B., Gilkerson R.W., Ginger M.L., Ginsberg H.N., Golab J., Goligorsky M.S., Golstein P., Gomez‑Manzano C., Goncu E., Gongora C., Gonzalez C.D., Gonzalez R., González‑Estévez C., González‑Polo R.A., Gonzalez‑Rey E., Gorbunov N.V., Gorski S., Goruppi S., Gottlieb R.A., Gozuacik D., Granato G.E., Grant G.D., Green K.N., Gregorc A., Gros F., Grose C., Grunt T.W., Gual P., Guan J.‑L., Guan K.‑L., Guichard S.M., Gukovskaya A.S., Gukovsky I., Gunst J., Gustafsson Å.B., Halayko A.J., Hale A.N., Halonen S.K., Hamasaki M., Han F., Han T., Hancock M.K., Hansen M., Harada H., Harada M., Hardt S.E., Harper J.W., Harris A.L., Harris J., Harris S.D., Hashimoto M., Haspel J.A., Hayashi S.‑i., Hazelhurst L.A., He C., He Y.‑W., Hébert M.‑J., Heidenreich K.A., Helfrich M.H., Helgason G.V., Henske E.P., Herman B., Herman P.K., Hetz C., Hilfiker S., Hill J.A., Hocking L.J., Hofman P., Hofmann T.G., Höhfeld J., Holyoake T.L., Hong M.‑H., Hood D.A., Hotamisligil G.S., Houwerzijl E.J., Høyer‑Hansen M., Hu B., Hu C.‑a.A., Hu H.‑M., Hua Y., Huang C., Huang J., Huang S., Huang W.‑P., Huber T.B., Huh W.‑K., Hung T.‑H., Hupp T.R., Hur G.M., Hurley J.B., Hussain S.N.A., Hussey P.J., Hwang J.J., Hwang S., Ichihara A., Ilkhanizadeh S., Inoki K., Into T., Iovane V., Iovanna J.L., Ip N.Y., Isaka Y., Ishida H., Isidoro C., Isobe K.‑i., Iwasaki A., Izquierdo M., Izumi Y., Jaakkola P.M., Jäättelä M., Jackson G.R., Jackson W.T., Janji B., Jendrach M., Jeon J.‑H., Jeung E.‑B., Jiang H., Jiang H., Jiang J.X., Jiang M., Jiang Q., Jiang X., Jiang X., Jiménez A., Jin M., Jin S.V., Joe C.O., Johansen T., Johnson D.E., Johnson G.V.W., Jones N.L., Joseph B., Joseph S.K., Joubert A.M., Juhász G., Juillerat‑Jeanneret L., Jung C.H., Jung Y.‑K., Kaarniranta K., Kaasik A., Kabuta T., Kadowaki M., Kågedal K., Kamada Y., Kaminskyy V.O., Kampinga H.H., Kanamori H., Kang C., Kang K.B., Kang K.I., Kang R., Kang Y.‑A., Kanki T., Kanneganti T.‑D., Kanno H., Kanthasamy A.G., Kanthasamy A., Karantza V., Kaushal G.P., Kaushik S., Kawazoe Y., Ke P.‑Y., Kehrl J.H., Kelekar A., Kerkhoff C., Kessel D.H., Khalil H., Kiel J.A.K.W., Kiger A.A., Kihara A., Kim D.R., Kim D.‑H., Kim D.‑H., Kim E.‑K., Kim H.‑R., Kim J.‑S., Kim J.H., Kim J.C., Kim J.K., Kim P.K., Kim S.W., Kim Y.‑S., Kim Y., Kimchi A., Kimmelman A.C., King J.S., Kinsella T.J., Kirkin V., Kirshenbaum L.A., Kitamoto K., Kitazato K., Klein L., Klimecki W.T., Klucken J., Knecht E., Ko B.C.B., Koch J.C., Koga H., Koh J.‑Y., Koh Y.H., Koike M., Komatsu M., Kominami E., Kong H.J., Kong W.‑J., Korolchuk V.I., Kotake Y., Koukourakis M.I., Kouri Flores J.B., Kovács A.L., Kraft C., Krainc D., Krämer H., Kretz‑Remy C., Krichevsky A.M., Kroemer G., Krüger R., Krut O., Ktistakis N.T., Kuan C.‑Y., Kucharczyk R., Kumar A., Kumar R., Kumar S., Kundu M., Kung H.‑J., Kurz T., Kwon H.J., La Spada A.R., Lafont F., Lamark T., Landry J., Lane J.D., Lapaquette P., Laporte J.F., László L., Lavandero S., Lavoie J.N., Layfield R., Lazo P.A., Le W., Le Cam L., Ledbetter D.J., Lee A.J.X., Lee B.‑W., Lee G.M., Lee J., Lee J.‑h., Lee M., Lee M.‑S., Lee S.H., Leeuwenburgh C., Legembre P., Legouis R., Lehmann M., Lei H.‑Y., Lei Q.‑Y., Leib D.A., Leiro J., Lemasters J.J., Lemoine A., Lesniak M.S., Lev D., Levenson V.V., Levine B., Levy E., Li F., Li J.‑L., Li L., Li S., Li W., Li X.‑J., Li Y.‑B., Li Y.‑P., Liang C., Liang Q., Liao Y.‑F., Liberski P.P., Lieberman A., Lim H.J., Lim K.‑L., Lim K., Lin C.‑F., Lin F.‑C., Lin J., Lin J.D., Lin K., Lin W.‑W., Lin W.‑C., Lin Y.‑L., Linden R., Lingor P., Lippincott‑Schwartz J., Lisanti M.P., Liton P.B., Liu B., Liu C.‑F., Liu K., Liu L., Liu Q.A., Liu W., Liu Y.‑C., Liu Y., Lockshin R.A., Lok C.‑N., Lonial S., Loos B., Lopez‑Berestein G., López‑Otín C., Lossi L., Lotze M.T., Low P., Lu B., Lu B., Lu B., Lu Z., Luciano F., Lukacs N.W., Lund A.H., Lynch‑Day M.A., Ma Y., Macian F., MacKeigan J.P., Macleod K.F., Madeo F., Maiuri L., Maiuri M.C., Malagoli D., Malicdan M.C.V., Malorni W., Man N., Mandelkow E.‑M., Manon S., Manov I., Mao K., Mao X., Mao Z., Marambaud P., Marazziti D., Marcel Y.L., Marchbank K., Marchetti P., Marciniak S.J., Marcondes M., Mardi M., Marfe G., Mariño G., Markaki M., Marten M.R., Martin S.J., Martinand‑Mari C., Martinet W., Martinez‑Vicente M., Masini M., Matarrese P., Matsuo S., Matteoni R., Mayer A., Mazure N.M., McConkey D.J., McConnell M.J., McDermott C., McDonald C., McInerney G.M., McKenna S.L., McLaughlin B., McLean P.J., McMaster C.R., McQuibban G.A., Meijer A.J., Meisler M.H., Meléndez A., Melia T.J., Melino G., Mena M.A., Menendez J.A., Menna‑Barreto R.F.S., Menon M.B., Menzies F.M., Mercer C.A., Merighi A., Merry D.E., Meschini S., Meyer C.G., Meyer T.F., Miao C.‑Y., Miao J.‑Y., Michels P.A.M., Michiels C., Mijaljica D., Milojkovic A., Minucci S., Miracco C., Miranti C.K., Mitroulis I., Miyazawa K., Mizushima N., Mograbi B., Mohseni S., Molero X., Mollereau B., Mollinedo F., Momoi T., Monastyrska I., Monick M.M., Monteiro M.J., Moore M.N., Mora R., Moreau K., Moreira P.I., Moriyasu Y., Moscat J., Mostowy S., Mottram J.C., Motyl T., Moussa C.E.‑H., Müller S., Muller S., Münger K., Münz C., Murphy L.O., Murphy M.E., Musarò A., Mysorekar I., Nagata E., Nagata K., Nahimana A., Nair U., Nakagawa T., Nakahira K., Nakano H., Nakatogawa H., Nanjundan M., Naqvi N.I., Narendra D.P., Narita M., Navarro M., Nawrocki S.T., Nazarko T.Y., Nemchenko A., Netea M.G., Neufeld T.P., Ney P.A., Nezis I.P., Nguyen H.P., Nie D., Nishino I., Nislow C., Nixon R.A., Noda T., Noegel A.A., Nogalska A., Noguchi S., Notterpek L., Novak I., Nozaki T., Nukina N., Nürnberger T., Nyfeler B., Obara K., Oberley T.D., Oddo S., Ogawa M., Ohashi T., Okamoto K., Oleinick N.L., Oliver F.J., Olsen L.J., Olsson S., Opota O., Osborne T.F., Ostrander G.K., Otsu K., Ou J.‑h.J., Ouimet M., Overholtzer M., Ozpolat B., Paganetti P., Pagnini U., Pallet N., Palmer G.E., Palumbo C., Pan T., Panaretakis T., Pandey U.B., Papackova Z., Papassideri I., Paris I., Park J., Park O.K., Parys J.B., Parzych K.R., Patschan S., Patterson C., Pattingre S., Pawelek J.M., Peng J., Perlmutter D.H., Perrotta I., Perry G., Pervaiz S., Peter M., Peters G.J., Petersen M., Petrovski G., Phang J.M., Piacentini M., Pierre P., Pierrefite‑Carle V., Pierron G., Pinkas‑Kramarski R., Piras A., Piri N., Platanias L.C., Pöggeler S., Poirot M., Poletti A., Poüs C., Pozuelo‑Rubio M., Prætorius‑Ibba M., Prasad A., Prescott M., Priault M., Produit‑Zengaffinen N., Progulske‑Fox A., Proikas‑Cezanne T., Przedborski S., Przyklenk K., Puertollano R., Puyal J., Qian S.‑B., Qin L., Qin Z.‑H., Quaggin S.E., Raben N., Rabinowich H., Rabkin S.W., Rahman I., Rami A., Ramm G., Randall G., Randow F., Rao V.A., Rathmell J.C., Ravikumar B., Ray S.K., Reed B.H., Reed J.C., Reggiori F., Régnier‑Vigouroux A., Reichert A.S., Reiners J.J., Jr, Reiter R.J., Ren J., Revuelta J.L., Rhodes C.J., Ritis K., Rizzo E., Robbins J., Roberge M., Roca H., Roccheri M.C., Rocchi S., Rodemann H.P., Rodríguez de Córdoba S., Rohrer B., Roninson I.B., Rosen K., Rost‑Roszkowska M.M., Rouis M., Rouschop K.M.A., Rovetta F., Rubin B.P., Rubinsztein D.C., Ruckdeschel K., Rucker E.B., Rudich A., Rudolf E., Ruiz‑Opazo N., Russo R., Rusten T.E., Ryan K.M., Ryter S.W., Sabatini D.M., Sadoshima J., Saha T., Saitoh T., Sakagami H., Sakai Y., Salekdeh G.H., Salomoni P., Salvaterra P.M., Salvesen G., Salvioli R., Sanchez A.M.J., Sánchez‑Alcázar J.A., Sánchez‑Prieto R., Sandri M., Sankar U., Sansanwal P., Santambrogio L., Saran S., Sarkar S., Sarwal M., Sasakawa C., Sasnauskiene A., Sass M., Sato K., Sato M., Schapira A.H.V., Scharl M., Schätzl H.M., Scheper W., Schiaffino S., Schneider C., Schneider M.E., Schneider‑Stock R., Schoenlein P.V., Schorderet D.F., Schüller C., Schwartz G.K., Scorrano L., Sealy L., Seglen P.O., Segura‑Aguilar J., Seiliez I., Seleverstov O., Sell C., Seo J.B., Separovic D., Setaluri V., Setoguchi T., Settembre C., Shacka J.J., Shanmugam M., Shapiro I.M., Shaulian E., Shaw R.J., Shelhamer J.H., Shen H.‑M., Shen W.‑C., Sheng Z.‑H., Shi Y., Shibuya K., Shidoji Y., Shieh J.‑J., Shih C.‑M., Shimada Y., Shimizu S., Shintani T., Shirihai O.S., Shore G.C., Sibirny A.A., Sidhu S.B., Sikorska B., Silva‑Zacarin E.C.M., Simmons A., Simon A.K., Simon H.‑U., Simone C., Simonsen A., Sinclair D.A., Singh R., Sinha D., Sinicrope F.A., Sirko A., Siu P.M., Sivridis E., Skop V., Skulachev V.P., Slack R.S., Smaili S.S., Smith D.R., Soengas M.S., Soldati T., Song X., Sood A.K., Soong T.W., Sotgia F., Spector S.A., Spies C.D., Springer W., Srinivasula S.M., Stefanis L., Steffan J.S., Stendel R., Stenmark H., Stephanou A., Stern S.T., Sternberg C., Stork B., Strålfors P., Subauste C.S., Sui X., Sulzer D., Sun J., Sun S.‑Y., Sun Z.‑J., Sung J.J.Y., Suzuki K., Suzuki T., Swanson M.S., Swanton C., Sweeney S.T., Sy L.‑K., Szabadkai G., Tabas I., Taegtmeyer H., Tafani M., Takács‑Vellai K., Takano Y., Takegawa K., Takemura G., Takeshita F., Talbot N.J., Tan K.S.W., Tanaka K., Tanaka K., Tang D., Tang D., Tanida I., Tannous B.A., Tavernarakis N., Taylor G.S., Taylor G.A., Taylor J.P., Terada L.S., Terman A., Tettamanti G., Thevissen K., Thompson C.B., Thorburn A., Thumm M., Tian F., Tian Y., Tocchini‑Valentini G., Tolkovsky A.M., Tomino Y., Tönges L., Tooze S.A., Tournier C., Tower J., Towns R., Trajkovic V., Travassos L.H., Tsai T.‑F., Tschan M.P., Tsubata T., Tsung A., Turk B., Turner L.S., Tyagi S.C., Uchiyama Y., Ueno T., Umekawa M., Umemiya‑Shirafuji R., Unni V.K., Vaccaro M.I., Valente E.M., Van den Berghe G., van der Klei I.J., van Doorn W., van Dyk L.F., van Egmond M., van Grunsven L.A., Vandenabeele P., Vandenberghe W.P., Vanhorebeek I., Vaquero E.C., Velasco G., Vellai T., Vicencio J.M., Vierstra R.D., Vila M., Vindis C., Viola G., Viscomi M.T., Voitsekhovskaja O.V., von Haefen C., Votruba M., Wada K., Wade‑Martins R., Walker C.L., Walsh C.M., Walter J., Wan X.‑B., Wang A., Wang C., Wang D., Wang F., Wang F., Wang G., Wang H., Wang H.‑G., Wang H.‑D., Wang J., Wang K., Wang M., Wang R.C., Wang X., Wang X.J., Wang Y.‑J., Wang Y., Wang Z.‑B., Wang Z.C., Wang Z., Wansink D.G., Ward D.M., Watada H., Waters S.L., Webster P., Wei L., Weihl C.C., Weiss W.A., Welford S.M., Wen L.‑P., Whitehouse C.A., Whitton J.L., Whitworth A.J., Wileman T., Wiley J.W., Wilkinson S., Willbold D., Williams R.L., Williamson P.R., Wouters B.G., Wu C., Wu D.‑C., Wu W.K.K., Wyttenbach A., Xavier R.J., Xi Z., Xia P., Xiao G., Xie Z., Xie Z., Xu D.‑z., Xu J., Xu L., Xu X., Yamamoto A., Yamamoto A., Yamashina S., Yamashita M., Yan X., Yanagida M., Yang D.‑S., Yang E., Yang J.‑M., Yang S.Y., Yang W., Yang W.Y., Yang Z., Yao M.‑C., Yao T.‑P., Yeganeh B., Yen W.‑L., Yin J.‑j., Yin X.‑M., Yoo O.‑J., Yoon G., Yoon S.‑Y., Yorimitsu T., Yoshikawa Y., Yoshimori T., Yoshimoto K., You H.J., Youle R.J., Younes A., Yu L., Yu L., Yu S.‑W., Yu W.H., Yuan Z.‑M., Yue Z., Yun C.‑H., Yuzaki M., Zabirnyk O., Silva‑Zacarin E., Zacks D., Zacksenhaus E., Zaffaroni N., Zakeri Z., Zeh H.J., 3rd, Zeitlin S.O., Zhang H., Zhang H.‑L., Zhang J., Zhang J.‑P., Zhang L., Zhang L., Zhang M.‑Y., Zhang X.D., Zhao M., Zhao Y.‑F., Zhao Y., Zhao Z.J., Zheng X., Zhivotovsky B., Zhong Q., Zhou C.‑Z., Zhu C., Zhu W.‑G., Zhu X.‑F., Zhu X., Zhu Y., Zoladek T., Zong W.‑X., Zorzano A., Zschocke J., Zuckerbraun B. Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy // Autophagy. 2012. V. 8, Nо 4. P. 445–544. https://doi.org/10.4161/auto.19496.

21. Mauthe M., Orhon I., Rocchi C., Zhou X., Luhr M., Hijlkema K‑J., Coppes R.P., Engedal N., Mari M., Reggiori F. Chloroquine inhibits autophagic flux by decreasing autophagosome-lysosome fusion // Autophagy. 2018. V. 14, No 8. P. 1435–1455. https://doi.org/10.1080/15548627.2018.1474314.

22. D’Arcy M.S. Cell death: A review of the major forms of apoptosis, necrosis and autophagy // Cell Biol. Int. 2019. V. 43, Nо 6. P. 582–592. https://doi.org/10.1002/cbin.11137.

23. Menon M.B., Dhamija S. Beclin 1 phosphorylation – at the center of autophagy regulation // Front. Cell Dev. Biol. 2018. V. 6. Art. 137. https://doi.org/10.3389/fcell.2018.00137.

24. Li W., He P., Huang Y., Li Y.‑F., Lu J., Li M., Kurihara H., Luo Z., Meng T., Onishi M., Ma C., Jiang L., Hu Y., Gong Q., Zhu D., Xu Y., Liu R., Liu L., Yi C., Zhu Y., Ma N., Okamoto K., Xie Z., Liu J., He R.‑R., Feng D. Selective autophagy of intracellular organelles: Recent research advances // Theranostics. 2021. V. 11, No 1. P. 222–226. https://doi.org/10.7150/thno.49860.

25. Lamark T., Kirkin V., Dikic I., Johansen T. NBR1 and p62 as cargo receptors for selective autophagy of ubiquitinated targets // Cell Cycle. 2009. V. 8, No 13. P. 1986–1990. https://doi.org/10.4161/cc.8.13.8892.

26. Nezis I.P., Simonsen A., Sagona A.P., Finley K., Gaumer S., Contamine D., Rusten T.E., Stenmark H., Brech A. Ref(2)P, the Drosophila melanogaster homologue of mammalian p62, is required for the formation of protein aggregates in adult brain // J. Cell Biol. 2008. V. 180, No 6. P. 1065–1071. https://doi.org/10.1083/jcb.200711108.

27. Jara O., Mysliwiec H., Minogue P.J., Berthoud V.M., Beyer E.C. p62/Sequestosome 1 levels increase and phosphorylation is altered in Cx50D47A lenses, but deletion of p62/sequestosome 1 does not improve transparency // Mol. Vision. 2020. V. 26. P. 204–215.

28. Bjørkøy G., Lamark T., Brech A., Outzen H., Perander M., Øvervatn A., Stenmark H., Johansen T. p62/SQSTM1 forms protein aggregates degraded by autophagy and has a protective effect on huntingtin-induced cell death // J. Cell Biol. 2005. V. 171, No 4. P. 603–614. https://doi.org/10.1083/jcb.200507002.

29. Karim M.R., Kanazawa T., Daigaku Y., Fujimura S., Miotto G., Kadowaki M. Cytosolic LC3 ratio as a sensitive index of macroautophagy in isolated rat hepatocytes and H4-II-E cells // Autophagy. 2007. V. 3, No 6. P. 553–560. https://doi.org/10.4161/auto.4615.

30. Bartlett B.J., Isakson P., Lewerenz J., Sanchez H., Kotzebue R.W., Cumming R.C., Harris G.L., Nezis I.P., Schubert D.R., Simonsen A., Finley K.D. p62, Ref(2)P and ubiquitinated proteins are conserved markers of neuronal aging, aggregate formation and progressive autophagic defects // Autophagy. 2011. V. 7, No 6. P. 572–583. https://doi.org/10.4161/auto.7.6.14943.

31. Луговая А.В., Эмануэль В.С., Артемова А.В., Митрейкин В.Ф. Современные подходы к оценке биологических маркеров аутофагии и апоптоза при остром ишемическом инсульте // Современные проблемы науки и образования. 2020. № 4. С. 159–174. https://doi.org/10.17513/spno.30017.

32. Kadowaki M., Karim M.R. Chapter 13 Cytosolic LC3 ratio as a quantitative index of macroautophagy. Ser.: Methods in Enzymology. V. 452: Autophagy in mammalian systems, part B / Klionsky D.J. (Ed.). San Diego, CA: Acad. Press, 2009. P. 199–213. https://doi.org/10.1016/S0076-6879(08)03613-6.

33. Jaber N., Zong W.‑X. Class III PI3K Vps34: Essential roles in autophagy, endocytosis, and heart and liver function // Ann. N. Y. Acad. Sci. 2013. V. 1280, No 1. P. 48–51. https://doi.org/10.1111/nyas.12026.

34. Kumar A.V., Mills J., Lapierre L.R. Selective autophagy receptor p62/SQSTM1, a pivotal player in stress and aging // Front. Cell Dev. Biol. 2022. V. 10. Art. 793328. https://doi.org/10.3389/fcell.2022.793328.

35. Bronietzki A.W., Schuster M., Schmitz I. Autophagy in T- c ell development, activation and differentiation // Immunol. Cell Biol. 2015. V. 93, No 1. P. 25–34. https://doi.org/10.1038/icb.2014.81.

36. Shevyrev D., Tereshchenko V. Treg heterogeneity, function, and homeostasis // Front. Immunol. 2020. V. 10. Art. 3100. https://doi.org/10.3389/fimmu.2019.03100.

37. Kabat A.M., Harrison O.J., Riffelmacher T., Moghaddam A.E., Pearson C.F., Laing A., Abeler‑Dörner L., Forman S.P., Grencis R.K., Sattentau Q., Simon A.K., Pott J., Maloy K.J. The autophagy gene Atg16/1 differentially regulates Treg and TH2 cells to control intestinal inflammation // eLife. 2016. V. 5. Art. e12444. https://doi.org/10.7554/eLife.12444.

38. Zhang J., Chen L., Xiong F., Zhang S., Huang K., Zhang Z., Wang C.‑Y. Autophagy in regulatory T cells: A double-edged sword in disease settings // Mol. Immunol. 2019. V. 109. P. 43–50. https://doi.org/10.1016/j.molimm.2019.02.004.